问答题 综合以上材料和分析，谈谈思想解放和近代自然科学两者之间的关系。

问答题 根据材料三，指出启蒙运动前后自然科学研究方法的主要变化。

问答题 根据材料二和所学知识，指出牛顿在科学上最主要的贡献及其思想价值。