单项选择题
下列选项中,哪一项不能帮助BLAST提升计算速度?()
A.使用较短的seed word
B.对数据库预先屏蔽重复性的低复杂度区域
C.选择邻居单字时,只选择高度相似的邻居单字
D.从最初始找到的hit里面去掉一些零散的hit,只保留hit cluster
E.提前给数据库建索引
F.不计算p-value,只计算E-value
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多项选择题
下列选项中,哪些项不能帮助BLAST降低假阳性?()
A.不仅使用来自查询序列的种子单字,还使用它们的邻居单字
B.提前给数据库建索引
C.不计算p-value,只计算E-value
D.使用较短的seed word
E.屏蔽重复性的低复杂度区域
F.选择邻居单字时,只选择高度相似的邻居单字 -
单项选择题
关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是()。
A.它表示了相应hit的可信度
B.它可以大于1
C.当它确定的时候,相应的p-value也是确定的
D.它和一开始输入的查询序列的长度以及数据库总序列长度都有关
E.它的值在接近1时,是几乎和相应的p-value一样的 -
单项选择题
一种替换在自然界中越容易发生,则这种替换在打分矩阵中对应的数值()。
A.越大
B.越小
C.不变
