某工程由甲方供应建筑材料。在施工过程中曾得到监理工程师质量认可的部分工程，竣工验收时发现未达到合同中约定的标准。由于施工质量缺陷位于工程次要部位，不影响工程的使用，监理工程师征得甲方同意后作出不需返工的决定。对此缺陷工程的处理应为（）。

A、乙方不承担责任，按合同约定的承包价结算
B、在承包价款中扣除该部分工程的全部材料费和施工承包价
C、在承包价款中扣除该部分工程的全部材料费
D、双方协调后要扣除一定幅度的承包价