开发性金融债券与国债的本质区别是，国债资金是用财政预算方式管理，没有损益平衡的要求，而且不承担体制建设的任务；开发性金融债券资金是以政府协调强化金融资产管理的方式，运用政府增信提高资产质量和资金效益，通过严格的本息回收实现损益平衡，进行全局性的体制建设和市场建设。